Mae clefyd yr afu yn derm cyffredinol ar gyfer pob clefyd sy'n digwydd yn yr afu.Gan gynnwys clefydau heintus, clefydau oncolegol, clefydau fasgwlaidd, clefydau metabolig, clefydau gwenwynig, clefydau hunanimiwn, clefydau etifeddol, megis colangiolithiasis intrahepatig.Mae gan bennu α-1-Antitryp Sin, ceruloplasmin, ategu, imiwnoglobwlin, transferrin a prealbumin arwyddocâd penodol wrth ddiagnosis rhai afiechydon yr afu.